Wpływ wariantów 17q21 i ekspozycji na palenie we wczesnej fazie astmy ad 7

Chociaż ogólna dobra powtarzalność raportu o paleniu przez rodziców w dzieciństwie została stwierdzona w EGEA, matki dzieci z astmą nie zgłosiły swoich nawyków palenia podczas kwestionowania narażenia ich dzieci na środowiskowy dym tytoniowy.27 Mogło to doprowadzić do błędnej klasyfikacji kilku osób. rodziny, które nie zostały poddane ekspozycji, a w konsekwencji konserwatywnemu testowi na heterogeniczność. Nasze stwierdzenie istotnego związku pomiędzy wariantami 17q21 i astmą o wczesnym początku u dzieci, które były narażone na środowiskowy dym tytoniowy, jest ogólnie zgodne z wynikami naszych poprzednich badań, ponieważ szczyt sprzężenia wynosił około 5 Mb od tych wariantów i tylko pary rodzeństwa z astmą, która we wczesnym okresie życia była narażona na środowiskowy dym tytoniowy, dzieliła część alleli markerowych o identycznym pochodzeniu w nadmiarze niż spodziewany pod hipotezą zerową bez powiązania.14 Obserwowaliśmy replikację związku w generacji rodzicielskiej; związek między markerami 17q21 i astmą o wczesnym początku był znaczący tylko wśród rodziców, którzy we wczesnym okresie życia byli narażeni na środowiskowy dym tytoniowy. Potencjalne zaniżone raportowanie wczesnego narażenia na środowiskowy dym tytoniowy przez tych rodziców27 mogło spowodować test zachowawczy, ale nie przyczyniłoby się do fałszywie pozytywnego wyniku. Markery 17q21 związane z astmą o wczesnym początku powodują zwiększone ryzyko wśród homozygot na allel związany z chorobą, który jest tego samego rzędu wielkości co ryzyko zgłaszane dla tych markerów w pierwotnym badaniu asocjacji genomewidu.6 Jednak ekspozycja na środowiskowy tytoń dym we wczesnym okresie życia wiąże się z jeszcze większym ryzykiem. Read more „Wpływ wariantów 17q21 i ekspozycji na palenie we wczesnej fazie astmy ad 7”

Wpływ wariantów 17q21 i ekspozycji na palenie we wczesnej fazie astmy ad 6

Wśród rodziców, którzy byli narażeni na środowiskowy dym tytoniowy, astma o wczesnym początku była istotnie związana z czterema SNP (P.0,01). W przeciwieństwie do tego, nie było dowodów na związek między rodzicami bez takiej ekspozycji (P.0,11). SNP, które najsilniej wiązały się z astmą o wczesnym początku, charakteryzowały się silnym brakiem sprzężenia między sobą, ze współczynnikiem równowagi sprzężenia parami D pomiędzy 0,87 i 1,0. Zaobserwowaliśmy również słabsze dowody powiązania choroby z innymi markerami z regionu (Tabela 5 w Dodatku Uzupełniającym), które wykazywały umiarkowaną nierównowagę sprzężeń z tymi SNP (Figura w Dodatku Aneks). Jednakże, gdy zastosowano regresję krokową do przodu, tylko SNP z najbardziej znaczącym związkiem choroby (rs8069176) weszły do modelu, co sugeruje, że powiązanie między kulami stanowiło podstawę dla tych obserwacji. Read more „Wpływ wariantów 17q21 i ekspozycji na palenie we wczesnej fazie astmy ad 6”

Wpływ wariantów 17q21 i ekspozycji na palenie we wczesnej fazie astmy ad 5

Wyniki te pozostały znaczące (P <1 × 10-3 dla czterech najsilniej związanych SNP) po konserwatywnej korekcie z poprawką Bonferroniego dla 108 przeprowadzonych testów (36 SNP testowanych we wczesnej podgrupie, podgrupa o późnym początku, i cała grupa). W przeciwieństwie do tego nie stwierdziliśmy istotnego związku z astmą, gdy wystąpił po 4 roku życia (Tabela 2). Testy na heterogenność związku z astmą pomiędzy dwiema niezależnymi próbkami rodzinnymi (152 rodziny z astmą o wczesnym początku i 175 rodzin z późną postacią astmy) były istotne w 10 z 11 SNP związanych z astmą (Tabela 2). Wczesne narażenie na dym tytoniowy
Tabela 3. Tabela 3. Read more „Wpływ wariantów 17q21 i ekspozycji na palenie we wczesnej fazie astmy ad 5”

Wpływ wariantów 17q21 i ekspozycji na palenie we wczesnej fazie astmy czesc 4

W powyższych analizach wykorzystaliśmy fenotyp i informacje o ekspozycji tylko z pokolenia potomnego. Przeprowadziliśmy drugi test powiązania między wczesną astmą a SNP 17q21 u rodziców, którzy we wczesnym okresie życia byli narażeni na środowiskowy dym tytoniowy oraz u tych, którzy nie mieli takiej ekspozycji, stosując dokładny test Fishera. Związek między markerami 17q21 i fenotypami związanymi z astmą badano za pomocą analizy regresji za pomocą oprogramowania Stata, wersja 10.0 (patrz sekcja Metody w dodatkowym dodatku). Wyniki
17q21 Warianty i astma
Tabela 1. Tabela 1. Read more „Wpływ wariantów 17q21 i ekspozycji na palenie we wczesnej fazie astmy czesc 4”