Wpływ wariantów 17q21 i ekspozycji na palenie we wczesnej fazie astmy czesc 4

W powyższych analizach wykorzystaliśmy fenotyp i informacje o ekspozycji tylko z pokolenia potomnego. Przeprowadziliśmy drugi test powiązania między wczesną astmą a SNP 17q21 u rodziców, którzy we wczesnym okresie życia byli narażeni na środowiskowy dym tytoniowy oraz u tych, którzy nie mieli takiej ekspozycji, stosując dokładny test Fishera. Związek między markerami 17q21 i fenotypami związanymi z astmą badano za pomocą analizy regresji za pomocą oprogramowania Stata, wersja 10.0 (patrz sekcja Metody w dodatkowym dodatku). Wyniki
17q21 Warianty i astma
Tabela 1. Tabela 1. Charakterystyka 1515 genotypowanych osobników z 372 rodzin. Tabela 2. Tabela 2. Związek między 11 polimorfizmami pojedynczego nukleotydu na chromosomie 17q21 i astmą, astmą o wczesnym początku i astmie późnej. Charakterystykę genotypowanych 1511 osobników należących do 372 rodzin EGEA przedstawiono w Tabeli 1. Kiedy analizowaliśmy dane bez stratyfikacji w zależności od wieku na początku astmy, stwierdziliśmy, że 11 z SNP 17q21 było znacząco związanych z astmą ( P <0,01). Spośród tych SNP trzy (rs8069176, rs2305480 i rs4795400) były silnie powiązane (P <0,001) (tabela 2 i tabela 2 w dodatkowym dodatku). Te trzy SNP były jednymi z najbardziej znaczącymi związkami (P.2,5 × 10-8) w początkowym badaniu asocjacji genomewidu.6.
17q21 Warianty i wiek na początku astmy
Rysunek 1. Rycina 1. Analiza regresji uporządkowanej podzbioru astmy za pomocą dwóch polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNP). Analiza regresji uporządkowanych podzbiorów, przeprowadzona dla 11 SNP, które miały istotny związek z astmą, wykazała, że maksymalna różnica statystyk testu stosunku prawdopodobieństwa dla związku pomiędzy uporządkowanymi pod względem wieku podzbiorami a próbką całkowitą została uzyskana dla wieku na początku astmy trwającej 4 lata lub krócej, w zależności od testowanego markera. Wykres pokazuje wyniki tej analizy dla 2 z 11 markerów, które były znacząco związane z astmą (rs9303277 i rs4795405), dla których maksymalne różnice w statystykach testu stosunku prawdopodobieństwa były odpowiednio najwyższe i najniższe.
Analiza regresji uporządkowanych podzbiorów, przeprowadzona dla 11 SNP istotnie związanych z astmą, wykazała, że maksymalną różnicę w statystykach testowych dla związku między uporządkowanymi podzbiorami charakterystycznymi dla danego wieku i całkowitą próbką uzyskano w wieku 4 lat lub młodszym, w zależności od testowanego markera (rysunek 1). Na podstawie 10 000 permutacji stwierdzono, że maksymalna różnica w statystykach testowych dla asocjacji jest znacząca dla wszystkich 11 markerów (empiryczne wartości P w zakresie od x 10-4 dla rs9303277 do 0,02 dla rs4795405). Następnie wykorzystaliśmy wiek 4 lat jako punkt odcięcia, aby przypisać badanych podgrupom o wczesnym początku i późnym początku.
W podgrupach o wczesnym początku znalazło się 235 osób z astmą wśród 1270 osób, a podgrupa z późnym początkiem obejmowała 395 osób z astmą wśród 1282 osób. Stwierdzono, że związek między SNP a astmą o wczesnym początku jest znacznie silniejszy niż w przypadku astmy jako całości (Tabela 2). Uzyskaliśmy P.7 × 10-4 dla 11 SNP i P <1 × 10-5 dla 4 SNPs, z najsilniejszymi asocjacjami przy rs9303277 (P = 3,1 × 10-6) i rs8069176 (P = 5,8 × 10 -6) [patrz też: art med, cannabis nasiona, zajecia dla kobiet w ciazy ]

Powiązane tematy z artykułem: art med cannabis nasiona zajecia dla kobiet w ciazy